Matière première n°3

8.3.2008 par admin.

Revue d’épistémologie et d’études matérialistes

Modèles, simulations, systèmes

Editions Syllepse - “Matériologiques” - Février 2008

• Présentation

Modèles, simulations, systèmes. Ce triptyque, réunissant des outils de connaissance, des moyens de connaître (les modèles, les simulations), et des objets extrêmement présents en biologie (les systèmes), a pour ambition de présenter quelques réflexions emblématiques des débats en cours sur ces questions, ainsi que des études de cas, principalement dans le domaine de la biologie. La simultanéité d’un regard sur les modèles-simulations et sur les systèmes nous permet de constater un fait épistémologique majeur : la montée en puissance du réalisme des modèles-simulations ainsi que l’essor d’une nouvelle biologie des systèmes, biologie réclamant d’importants moyens de calcul et des outils conceptuels à la hauteur du déferlement de données expérimentales qui caractérise, notamment, cette approche de la biologie. Les interrogations cruciales que suscite cette dernière, par exemple quant à l’existence et à la mise en évidence de principes généraux du vivant ou de lois du vivant, sont également explorées ici.

• Les auteurs

Les auteurs de ce dossier thématique sont : Anouk Barberousse, philosophe, IHPST, Paris ; Gilbert Chauvet, biophysicien, EPHE, Paris ; Sarah Franceschelli, philosophe, ENSLS-H, Lyon ; Olivier Gandrillon, biologiste moléculaire, université Lyon 1 ; Cyrille Imbert, philosophe, université de Caen ; Evelyn Fox Keller, philosophe, MIT, USA ; Jean Lassègue, philosophe, CREA, Paris ; Soazig Le Bihan, philosophe, Illinois Institute of Technology, Chicago ; Giuseppe Longo, mathématicien, ENS, Paris ; Jean-Pierre Mazat, biochimiste, INSERM, Bordeaux ; Denis Noble, physiologiste, université d’Oxford ; Franck Varenne, historien des sciences, philosophe, université de Rouen et CNRS ; Bernard Walliser, économiste, Ponts-et-Chaussées, Paris. Ce dossier se clôt par l’hommage rendu par Marc Jarry (biologiste, université de Pau) et Marc Artzrouni (mathématicien, université de Pau) au biologiste modélisateur Jean-Paul Gouteux, mort en 2006.
Dans sa partie « Varia », cet ouvrage présente un long article de David Piotrowski (linguiste, CREA, CNRS, Paris) sur le statut épistémologique de la linguistique et la nature de son objet. La partie « Impostures intellectuelles » donne la parole au politologue David Forest, qui rend compte de la litanie des légèretés de nos médiatiques futurologues.

• Extrait de l’Introduction : “Modèles, simulations, systèmes”

” Il est loin le temps où Bachelard pouvait dire que la valeur d’un modèle en sciences tenait essentiellement à sa capacité à être nié. Entre-temps
les modèles, sous diverses formes - souvent inédites -, n’ont cessé de se diffuser dans les différentes sciences, contribuant à la métamorphose de leurs méthodologies. Cette remarquable et large diffusion est liée à deux faits incontestables. D’une part, depuis la fin du 1è siècle, les modèles en usage dans les sciences ont subi ce qu’on peut appeler une série de tournants formels. D’iconiques ou analogiques au départ (comme encore chez Faraday, Maxwell, Hertz ou Boltzmann), à des dates parfois très différentes selon les disciplines et pour des raisons diverses, mais se rapportant finalement toutes à des motivations de praticabilité (figurabilité, reproductibilité, communicabilité, etc.) puis de calculabilité, les modèles sont devenus de plus en plus symboliques. Rappelons que, depuis les lectures peirciennes des modèles scientifiques par Max Black (1962) et Gerhard Frey (1961), un modèle peut être dit «iconique» lorsque - comme l’icône chez Peirce - il est supposé reproduire à l’identique certaines des caractéristiques de ce qu’il modélise. Notons en première approche qu’un modèle peut être physique - c’est-à-dire constitué de matériaux physiques perceptibles ou imaginables - sans être iconique au sens strict, c’est-à-dire sans que son usage suppose qu’une au moins de ces propriétés physiques qui le caractérisent se retrouve à l’identique dans ce qu’il est censé modéliser. “

• Table des “matières”

Introduction: Modèles, simulations, systèmes - Franck Varenne, Marc Silberstein, Jean-Jacques Kupiec, Guillaume Lecointre

Partie 1.1 : épistémologie des modèles et des simulations
La conception sémantique des théories scientifiques. II. Comment peut-elle rester «sémantique»? - Soazig Le Bihan
Turing, entre le formel de Hilbert et la forme de Goethe - Jean Lassègue
Simulations numériques et expérimentation - Anouk Barberousse, Sara Franceschelli & Cyrille Imbert
Que peut expliquer un modèle complexe et peut-on le comprendre? - Pierre-Alain Braillard
Biologie des systèmes et recherche des lois générales - Evelyn Fox Keller
Des sciences exactes aux phénomènes du vivant, à partir de Schr6dinger: mathématiques, programme et modèles - Giuseppe Longo
Modèles et simulations: pluriformaliser, simuler, remathématiser- Franck Varenne

Partie 1.2: Pratiques et usages des modèles et des simulations
Les modèles de l’économie cognitive - Bernard Walliser
Sur le rôle de la théorie en biologie. Un exemple de théorie biologique intégrative: la MTlP - Gilbert A. Chauvet
Une petite histoire de la modélisation du métabolisme cellulaire. Vers une théorie du métabolisme en biologie - Jean-Pierre Mazat
Principes de la biologie des systèmes et leurs applications en modélisation - Denis Noble
Modélisation moléculaire individu-centrée: contribution à une biologie des systèmes - Olivier Gandrillon

Partie 2: Hommage
Un hommage à Jean-Paul Gouteux: la randonnée d’un biologiste au pays des mathématiques - Marc Jarry & Marc Artzrouni

Partie 3 : Varia
Sur le statut épistémologique de la linguistique et la nature de son objet- David Piotrowski

Partie 4: Impostures intellectuelles
Quand la futurologie rencontre le grand public: permanence et constance d’une vulgate. Lectures croisées de Jacques Attali et de Joël de Rosnay - David Forest

Index des noms
Les contributeurs

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